چکیده زمینه و هدف: هسته آمیگدال یکی از هسته‌های ساب کورتیکال وابسته به سیستم لیمبیک است که در فعالیتهای رفتاری، نباتی و اندوکرین نقش بسیار مهمی دارد. دوگانگی جنسی در بعضی از هسته های آمیگدال مورد توجه محققین بوده است. مطالعه حاضر در پی یافتن این پرسش می باشد که آیا حجم کل آمیگدال در دو جنس به لحاظ مورفومتریک متفاوت است؟ مواد و روش کار: این مطالعه بر روی تعداد 20 سر رت بالغ از نژاد ویستار ( 10 سر نر –10 سر ماده )هشت هفته‌ای با وزن متوسط 260-240 گرم) انجام گرفت. پس از خارج نمودن مغزها در فرمالین 10% فیکس و برش‌های 01 میکرونی از کل مغز بوسیله میکروتوم تهیه گردید. پس از رنگ‌آمیزی با کریزل ویوله 1% حدود هسته مشخص و حجم کل هسته آمیگدال را به روش کاوالیاری محاسبه گردید. یافته ها: حجم هسته آمیگدال در رتهای نرmm3 12 /0  07/2 و در رت‌های ماده mm3 11/0  57/1 محاسبه گردید (05/0 P<). نتیجه‌گیری: براساس نتایج بدست آمده حجم کل هسته آمیگدال در رتهای نر بیشتر از حجم کل هسته آمیگدال در رتهای ماده است که نشانگر تاثیر دی مورفیسم جنسی بر کل هسته آمیگدال در دو جنس می‌باشد. یافته های این مطالعه می تواند در مطالعات تکاملی دی مورفیسم در انسان کاربرد داشته باشد.