دوره 10، شماره 4 - ( زمستان 1397 )
جلد 10 شماره 4 صفحات 67-61 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Ghazaey Zidanloo S, Jafarzadeh Hesari M. In silico screening of G-Quadruplex Structures in Wilms tumor 1 Gene Promoter. North Khorasan University of Medical Sciences 2019; 10 (4) :61-67
URL: http://journal.nkums.ac.ir/article-1-1664-fa.html
URL: http://journal.nkums.ac.ir/article-1-1664-fa.html
قضایی زیدانلو سعیده، جعفرزاده مهسا. شناسایی in silico ساختارهای DNA چهاررشته ای در توالی پروموتری ژن تومور ویلمز. مجله دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی. 1397; 10 (4) :61-67
1- دکترای تخصصی، گروه زیست شناسی سلولی و مولکولی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه کوثر، بجنورد، ایران ، Ghazaeys@kub.ac.ir
2- کارشناس ارشد اپیدمیولوژی، مرکز تحقیقات اعتیاد و علوم رفتاری، معاونت تحقیقات و فناوری، دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی، بجنورد، ایران
2- کارشناس ارشد اپیدمیولوژی، مرکز تحقیقات اعتیاد و علوم رفتاری، معاونت تحقیقات و فناوری، دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی، بجنورد، ایران
چکيده: (3292 مشاهده)
مقدمه: مطالعات پراش اشعه ایکس آشکار کرد که گوانین‌های موجود در یک رشته ممکن است به شکل چهارتایی آرایش یابند و یک ساختار چهار رشته‌ای بنام مارپیچ چهار رشته‌ای گوانینی تشکیل دهند. مطالعات بیوانفورماتیک، احتمال تشکیل ساختار چهار رشته‌ای گوانینی را در ژن‌های کلیدی انسان از جمله تومور ویلمز 1 (WT1) مطرح نمودند. هدف این مطالعه، بررسی in silico توالی غنی از گوانین در پروموتر ژن WT1 از لحاظ مستعد بودن برای تشکیل ساختار چهار رشته درون‌مولکولی بود.
روش کار: برای شناسایی حضور توالی‌های مستعد چهار رشته شدن در ناحیه تنظیمی ژن WT1، ابتدا توالی پروموتری ژن از بانک ژنی NCBI استخراج شد. توالی مورد نظر توسط نرم افزار نقشه یاب آنلاین توالی‌های پلی‌گوانینی مستعد چهاررشته شدن (QGRS Mapper)، از لحاظ حضور نواحی مستعد چهاررشته شدن بررسی شد.
یافته ها: با استفاده از داده های حاصل از بررسی با نرم افزار نقشه یاب، بر اساس نمره G، سه توالی‌های مناسب در ناحیه پروموتری ژن WT1، با بیشترین احتمال برای تشکیل ساختار چهار رشته‌ای شناسایی شد. نکته ارزشمند در این بررسی، حضور جایگاه‌های شناسایی تعداد زیادی از فاکتورهای رونویسی در این سه ناحیه بود.
نتیجه گیری: اغلب توالی های مستعد چهاررشته شدن در مناطق پروموتری آنکوژن‌ها واقع شده اند. این یافته ها، دانشمندان را به این سو هدایت کرده که این ساختارها ممکن است دارای نقش مهم فیزیولوژیکی در شرایط درون سلول باشند. پس با شناسایی و هدف قرار دادن این توالی ها در نواحی تنطیمی ژن‌ها، می‌توان بیان آن ژن را کنترل نمود
روش کار: برای شناسایی حضور توالی‌های مستعد چهار رشته شدن در ناحیه تنظیمی ژن WT1، ابتدا توالی پروموتری ژن از بانک ژنی NCBI استخراج شد. توالی مورد نظر توسط نرم افزار نقشه یاب آنلاین توالی‌های پلی‌گوانینی مستعد چهاررشته شدن (QGRS Mapper)، از لحاظ حضور نواحی مستعد چهاررشته شدن بررسی شد.
یافته ها: با استفاده از داده های حاصل از بررسی با نرم افزار نقشه یاب، بر اساس نمره G، سه توالی‌های مناسب در ناحیه پروموتری ژن WT1، با بیشترین احتمال برای تشکیل ساختار چهار رشته‌ای شناسایی شد. نکته ارزشمند در این بررسی، حضور جایگاه‌های شناسایی تعداد زیادی از فاکتورهای رونویسی در این سه ناحیه بود.
نتیجه گیری: اغلب توالی های مستعد چهاررشته شدن در مناطق پروموتری آنکوژن‌ها واقع شده اند. این یافته ها، دانشمندان را به این سو هدایت کرده که این ساختارها ممکن است دارای نقش مهم فیزیولوژیکی در شرایط درون سلول باشند. پس با شناسایی و هدف قرار دادن این توالی ها در نواحی تنطیمی ژن‌ها، می‌توان بیان آن ژن را کنترل نمود
نوع مطالعه: مقالات مروری |
موضوع مقاله:
علوم پایه
دریافت: 1397/3/23 | پذیرش: 1397/5/3 | انتشار: 1397/12/26
دریافت: 1397/3/23 | پذیرش: 1397/5/3 | انتشار: 1397/12/26
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
