دوره 3، شماره 5 و S5 - ( ویژه نامه90 آماری 1390 )                   جلد 3 شماره 5 و S5 صفحات 78-67 | برگشت به فهرست نسخه ها


XML English Abstract Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Shakeri M, Sabaghian E, Esmaeili H. CCK (Clustering-Classification-Kappa) a new validation index to assessing clustering results of gene expression data. North Khorasan University of Medical Sciences 2012; 3 (5) :67-78
URL: http://journal.nkums.ac.ir/article-1-251-fa.html
شاکری محمد تقی، صباغیان احسان، اسماعیلی حبیب الله. مقایسه روش‌های خوشه‌بندی در داده‌های بیان ژنی. مجله دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی. 1390; 3 (5) :67-78

URL: http://journal.nkums.ac.ir/article-1-251-fa.html


1- ، دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی مشهد
2- دانشگاه علوم پزشکی مشهد
3- دانشکده بهداشت، دانشگاه علوم پزشکی مشهد
چکيده:   (4715 مشاهده)

چکیده زمینه و هدف: با گسترش روش‌های استخراج داده‌های ژنتیکی، روش‌های تجزیه و تحلیل این نوع داده‌ها نیز در حال توسعه می‌باشند. این مطالعه با هدف مقایسه یکی از پرکاربردترین روش‌های تجزیه و تحلیل این نوع داده ها، یعنی خوشه‌بندی انجام شده است. مواد و روش کار: در این پژوهش با استفاده از 5 مجموعه داده مایکروآرایه، نه ترکیب روش خوشه‌بندی سلسله مراتبی تجمعی، سلسله مراتبی تقسیم‌شونده و K- میانگین با متریک‌های فاصله اقلیدسی، منهاتان و ضریب همبستگی پیرسون پیوند و با استفاده از شاخص پهنای نیمرخ با استفاده از روش نمونه‌گیری بوت استرپ مقایسه شده است. یافته‌ها: نتایج نشان داد روش خوشه‌بندی سلسله مراتبی تجمعی با پیوند متوسط دارای بهترین عملکرد بود. همچنین این روش در مقایسه با دیگر روش‌ها از پایایی بیشتری برخوردار بود. درعین حال روش خوشه‌بندی سلسله مراتبی تقسیم شونده عملکرد نسبتاً مشابهی با روش خوشه‌بندی K- میانگین داشته است. نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج می توان گفت که مبتنی بر شرایط موجود در داده ها بهترین روش‌ خوشه‌بندی انتخاب می شود

متن کامل [PDF 444 kb]   (2494 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی | موضوع مقاله: علوم پایه
دریافت: 1393/11/16 | پذیرش: 1393/11/16 | انتشار: 1393/11/16

ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی می‌باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2024 CC BY-NC 4.0 | Journal of North Khorasan University of Medical Sciences

Designed & Developed by: Yektaweb