دوره 18، شماره 2 - ( تابستان 1405 )                   جلد 18 شماره 2 صفحات 66-56 | برگشت به فهرست نسخه ها

Ethics code: IR.TBZMED.VCR.REC.1403.286

XML English Abstract Print

Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Hosseini S A, Mokhtarzadeh A A, Ghorbian S, Ahmadizadeh C. Bioinformatics Evaluation of the Association between LncRNA Linc00162 Gene and the Expression Alterations of Genes Involved in the PI3K/AKT/mTOR Signaling Pathway in Patients with Gastric Cancer. North Khorasan University of Medical Sciences 2026; 18 (2) :56-66
URL: http://journal.nkums.ac.ir/article-1-3384-fa.html
حسینی سید علی، مختارزاده امیرعلی، قربیان سعید، احمدی زاده چنگیز. ارزیابی بیوانفورماتیکی ارتباط بین ژن LncRNA Linc00162 با تغییرات بیان ژن‌های درگیر در مسیر سیگنالی P‌I3K/AKT/mTOR در بیماران مبتلابه سرطان معده. مجله دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی. 1405; 18 (2) :56-66

URL: http://journal.nkums.ac.ir/article-1-3384-fa.html

ارزیابی بیوانفورماتیکی ارتباط بین ژن LncRNA Linc00162 با تغییرات بیان ژن‌های درگیر در مسیر سیگنالی P‌I3K/AKT/mTOR در بیماران مبتلابه سرطان معده
سید علی حسینی1 ، امیرعلی مختارزاده*2 ، سعید قربیان3 ، چنگیز احمدی زاده1
1- گروه بیولوژی، واحد اهر، دانشگاه آزاد اسلامی، اهر، ایران
2- مرکز تحقیقات ایمونولوژی، دانشگاه علوم پزشکی تبریز، تبریز، ایران ، ahad.mokhtarzadeh@gmail.com
3- گروه بیولوژی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران
چکيده:   (43 مشاهده)
مقدمه: سرطان معده یکی از شایع‌ترین بدخیمی‌های دستگاه گوارش است که با مرگ‌ومیر قابل‌توجهی همراه است. شواهد اخیر نشان می‌دهد که lncRNAها، به‌عنوان تنظیم‌کننده‌های مهم بیان ژن، در پیشرفت سرطان نقش کلیدی ایفا می‌کنند. در این مطالعه، نقش lncRNA PICSAR (LINC00162) در تنظیم بیان ژن‌های مسیر سیگنالینگ PI3K/AKT/mTOR در سرطان معده بررسی شد.
روش کار: داده‌های بیان ژن از پایگاه TCGA و مجموعه داده‌های مرتبط با سرطان معده استخراج شد. ژن‌های با بیان متفاوت (DEGs) با استفاده از بسته‌هایDESeq2  و edgeR در محیط نرم‌افزاری R شناسایی شدند. به‌منظور تعیین ژن‌های مشترک بین DEGs و ژن‌های هم‌بیان‌شده با PICSAR، تحلیل ون (Venn analysis) صورت گرفت. در ادامه، تحلیل بررسی عملکردی مسیرها با بهره‌گیری از ابزار آنلاین Enrichr و پایگاه‌ داده KEGG انجام شد و مسیرهای معنادار براساس 05/0P< تعدیل‌شده شناسایی شدند.
یافته‌ها: از میان ۴۶۴۰ ژن با بیان متفاوت و ۹۸۸ ژن هم‌بیان‌شده با PICSAR، تعداد ۱۶۳ ژن مشترک شناسایی شدند. تحلیل غنی‌سازی مسیر نشان داد که ژن‌های هم‌پوشان در مسیرهای متعددی، ازجمله سیگنالینگ PI3K/AKT/mTOR، تعامل ECM-گیرنده و هدایت آکسونی، متمرکز شده‌اند. همچنین، ده ژن کلیدی، شامل MMP7، KRT7، WNT10A،SEMA7A  و PMEPA1، بیشترین هم‌بستگی را باPICSAR  و بیشترین تغییر بیان را در بیماران مبتلابه سرطان معده نشان دادند.
نتیجه‌گیری: نتایج این مطالعه نشان می‌دهد که lncRNA PICSAR با تنظیم ژن‌های کلیدی در مسیر PI3K/AKT/mTOR و دیگر مسیرهای مرتبط با سرطان، نقش مهمی در پیشرفت سرطان معده ایفا می‌کند. این یافته‌ها بیانگر پتانسیل زیادPICSAR  به‌عنوان نشانگر زیستی و هدف درمانی در مدیریت سرطان معده هستند.
 
واژه‌های کلیدی: LncRNA، سرطان معده، Linc00162، PI3K/AKT/mTOR
متن کامل [PDF 1805 kb]   (14 دریافت)    
نوع مطالعه: مقاله پژوهشی | موضوع مقاله: علوم پایه
دریافت: 1404/8/20 | پذیرش: 1404/10/16 | انتشار: 1405/4/10
ارسال نظر درباره این مقاله : نام کاربری یا پست الکترونیک شما:
CAPTCHA
ارسال پیام به نویسنده مسئول

بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.

کلیه حقوق این وب سایت متعلق به مجله دانشگاه علوم پزشکی خراسان شمالی می‌باشد.

طراحی و برنامه نویسی : یکتاوب افزار شرق

© 2026 CC BY-NC 4.0 | Journal of North Khorasan University of Medical Sciences

Designed & Developed by: Yektaweb